Dans un futur proche, Vincent travaille à Gattaca, le centre spatial d’un monde où la génétique permet de trier les hommes entre « valides » et « non-valides ». Ayant donné tous les gages d’excellence, il est sélectionné pour partir dans l’espace. Un des directeurs du centre est assassiné. C’est certainement un non-valide qui a commis le meurtre.
Un flashback raconte l’histoire de Vincent, celle d’un enfant conçu naturellement, qui souffre d’une malformation cardiaque. Pour leur deuxième enfant, ses parents choisissent de faire confiance à la technologie génétique et mettent au monde Anton. Les deux frères passent leur jeunesse à se défier. Vincent redouble d’efforts pour égaler Anton, mais, comme non-valide, il est cantonné à une vie de subalterne.
Pour tromper le contrôle de la société, Vincent s’allie à Jérôme, un ancien sportif de haut niveau devenu tétraplégique. Ce dernier lui prête ses attributs génétiques, permettant à Vincent d’être considéré apte à partir dans l’espace.
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